Em 29 de janeiro de 1976, a fusão entre os departamentos de futebol do América e do Caxias deram origem ao Joinville Esporte Clube. Logo no primeiro mês de fundação, o JEC enfrentou o Vasco da Gama, do Rio de Janeiro, em partida amistosa que terminou empatado em 1 a 1. Tonho foi o autor do primeiro gol da história do clube, enquanto Roberto Dinamite marcou para os cariocas.
Em outubro do mesmo ano, o Joinville mostrava já estar forte no cenário regional e aplicou a maior goleada dos seus 35 anos de vida: 11 a 1 diante do Ipiranga FC, em amistoso na cidade de Tangará (SC). Em seu primeiro ano de história foram 63 jogos disputados , entre partidas oficiais e amistosas, com 37 vitórias, 15 empates e 11 derrotas. Foram marcados 103 gols e sofridos apenas 41. Fontan terminou a temporada com 29 tentos, sagrando-se o artilheiro do time. | |  |
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A trajetória de vitórias começou cedo com a conquista do Estadual já no ano de fundação. Foram oito títulos catarinenses consecutivos entre os anos de 1978 e 1985 – recorde que não conseguiu ser superado até hoje. De 1988 a 1999, passou o mais longo período sem títulos de sua história. A sequência foi quebrada com a conquista do bicampeonato estadual de 2000 e 2001, ano do último troféu da primeira divisão erguido pelo clube.
Em 2007, o Joinville fez a pior campanha de sua história no Campeonato Catarinense, terminando em penúltimo lugar, na zona de rebaixamento. Depois disputou e venceu a Divisão Especial e retornou à elite do torneio estadual já em 2008.
No ano de 2009 o Joinville começa o seu projeto de reconstrução, terminando o campeonato em terceiro lugar e em 2010 conquista o vice-campeonato Catarinense. Em 2011 foi eliminado nas semi-finais no turno e returno, terminando na quarta colocação.
No cenário nacional, o Joinville esteve na Série A do Campeonato Brasileiro por 10 anos consecutivos, entre 1977 e 1986. Sua melhor campanha foi em 85, com a oitava colocação, sendo eliminado pelo Coritiba, que sagrou-se campeão daquele ano. Em 2010 disputou o Série D após conquistar o título da Copa Santa Catarina de 2009, e terminou desclassificado nas quartas-final pelo América (AM), logo após a derrota, o setor jurídico do clube identificou que o adversário havia utilizado um jogador irregular nas duas partidas disputadas, e desta vez, o time conseguiu o tão esperado retorno à Série C. No dia 17 de outubro de 2011, o JEC consolidou sua ida para Série B ao ganhar do Brasiliense por 4 a 1, com duas rodadas de antecedência e, com a derrota do Ipatinga para o Brasiliense, garantiu classificação para a final da Série C. No primeiro jogo contra o CRB, vitória do Joinville em pleno Estádio Rei Pelé, em Maceió por 3 a 1. Na volta, a equipe venceu por 4 a 0 na Arena Joinville e conquistou seu primeiro título nacional. |
